Die Schulleitung ist für die operative Leitung und Gestaltung der Schule zuständig. Dazu gehören die pädagogische Führung und Entwicklung, die organisatorische und finanzielle Führung, die Personalführung sowie verschiedene Planungs- und Projektarbeiten.
Als Standortschulleitung ist fürs Chliriet Remo Manser verantwortlich. In Zusammenarbeit mit Anna Spånning, die die Gesamtschulleitung innehat, wird somit eine lückenlose Präsenz gewährleistet.